1
Mountain Villa Bandaged Man Murder Case
Episode : episode 35-36 / Julai 2004
Korban / Cara pembunuhan: Chikako Ikeda / Potong kepala dan mutilasi
Episode ini merupakan salah satu episode yang terkenal paling menyeramkan. Banyak yang berpendapat kes Mountain Villa Bandaged Man Murder Case adalah kasus terbaik.
2
Night Baron Murder Case
Episode / tanggal tayang: Episode 70-72
Korban / Cara pembunuhan: Tokio Ebara / Terjatuh dari balkon dan tertancap di tombak patung
Kes Night Baron Murder Case mengangkat salah satu karakter Yusaku Kudo, ayah Conan, yaitu Night Baron. Latar tempat adalah acara makan malam dengan agenda melihat pertunjukkan yang diperankan oleh Night Baron.
3
Wealthy Daughter Murder Case
Episode : episode 40-41 / Juli 2004
Korban / Cara pembunuhan: Yuji Nikaido & Reika Yotsui / Ditenggelamkan
Episode ini mengisahkan tentang pesta ulang tahun untuk Reika, puteri seorang jutawan. Detektif Mouri yang terkenal diundang sebagai salah satu tetamu kehormat.
4
Roller Coaster Muder Case
Episode : episode 1 / Mei 2004
Korban / Cara pembunuhan: Kishida / Kehilangan kepala saat naik roller coaster
Kes pembunuhan ini merupakan episode pertama dari anime Detective Conan. Kes ini pun masih ditangani oleh Conan yang dewasa , iaitu Shinichi Kudo.
5
Final “Ahhh” Muder Case
Episode : Episode filler 144 / Juni 2006
Korban / Cara pembunuhan: Nobuo Yamamoto / DItembak di mulut
Meskipun hanya episode filler, namun cara pembunuhan yang dilakukan merupakan salah satu yang tragis dari banyak-banyak episode Detective Conan.
6
The Trembling Police Headquarters: 12 Million Hostages
Episode / tarikh tayang: Januari 2003
Korban / Cara pembunuhan: Matsuda Jinpei / terkena bom di dalam komidi putar
Episode The Trembling Police Headquarters: 12 Million Hostages salah satunya mengangkat kisah hero namun memilukan tiga tahun yang lalu.
